Spécialiste de physiologie environnementale et de biodiversité, il a longtemps travaillé sur la migration des poissons salmonidés et a abordé par des approches de physiologie expérimentale et d'endocrinologie divers mécanismes adaptatifs et évolutifs chez les animaux. Il s'est particulièrement intéressé aux mécanismes du développement, de la croissance et de l'adaptation chez les poissons. Il a beaucoup travaillé et écrit en matière de bases biologiques de l'aquaculture et de biodiversité, marine et continentale. Il est l'auteur de plus de 400 publications nationales et internationales (h-index à 33, près de 3 000 citations, moyenne > 27), participations à des Congrès et est fréquemment invité à l'étranger. Il a coorganisé avec Bernard Swynghedauw et Jean-François Toussaint, en octobre 2010, le colloque « L'Homme peut-il s'adapter à lui-même ? » au Muséum (conférences téléchargeables sur canal-insep.fr, livre paru chez Quae en novembre 2012) et, en novembre 2011, le colloque intitulé « La biodiversité et son évolution, limites de l'adaptabilité des systèmes » à la Fondation des Treilles, dans le Var. Il a coorganisé, avec le Commissariat général au développement durable, un colloque sur la bio-inspiration et le biomimétisme qui s'est tenu au Muséum le 10 décembre 2012. Il a animé le thème « Biodiversité » à la conférence environnementale du Conseil économique, social et environnemental en septembre 2012. Il a participé au colloque de l'Agence nationale de la recherche, « 8 ans de recherche sur l'environnement », en décembre 2012, au Collège de France. Enfin, il a prononcé une des conférences d'ouverture du colloque international du Conseil économique social et environnemental, « La haute mer, avenir de l'humanité », le 11 avril 2013.

Gilles Boeuf donne de nombreuses conférences en France et à l'étranger (plus de 80 en 2013) au sujet de l'océan, de la biodiversité, de l'adaptation au milieu, du rôle de l'eau dans le vivant et des ressources vivantes marines. Il a été très impliqué dans les événements de l'année internationale 2010, dédiée à la biodiversité, avec plus de 60 conférences comme l'ouverture du colloque de l'Unesco à Paris en janvier et l'ouverture de la semaine française de la biodiversité à Chamonix en mai, et a également fait de très nombreuses interventions en 2011, 2012 et 2013.

1994‐2006

Entre IFREMER Brest et Observatoire Océanologique de Banyuls

Avec l'abandon en France du développement aquacole en matière de salmoniculture marine, l'IFREMER a décidé d'arrêter les travaux cités ci‐dessus et d'ouvrir des travaux de recherche fondamentale sur les poissons marins (essentiellement le loup et le turbot). Les investigations ont dés lors porté sur le développement embryonnaire et la reproduction de ces espèces avec le même type d'approches, physiologique et endocrinienne. Gilles Boeuf a alors fondé un groupement d'intérêt scientifique (1994‐1999) avec l'IFREMER, l'INRA, le CNRS, les universités de Bretagne Occidentale, de Bordeaux 1, Rennes 1, Orsay Paris‐sud et UPMC. Des travaux ont été développés sur l'influence de la température, la salinité, l'alternance jour‐nuit, l'hypoxie, la présence d'ammoniaque… sur l'état de santé et les capacités adaptatives. La protéine canal chlore (CFTR) a été clonée dans la branchie de saumon et la glande rectale de roussette, et un parallèle a été établi entre le type de mutation (génotype) et la sévérité de l'expression (phénotype) de la mucoviscidose chez l'humain (Molecular Biology and Evolution en 2001), avec Claude Férec à Brest. Après avoir quitté l'IFREMER à Brest pour l'Observatoire océanologique de Banyuls (UPMC) en 1999, ces recherches ont pu être poursuivies grâce à l'organisation d'une équipe « physiologie environnementale et neuroendocrinologie » avec Jack Falcón, au sein de l'UMR « Modèles en biologie cellulaire et évolutive » puis « Biologie intégrative des organismes marins ». Ses travaux ont porté sur l'hormone mélatonine et les deux enzymes de conversion de la sérotonine en mélatonine (AANAT et HIOMT), à la fois dans la rétine et dans la glande pinéale, avec des approches moléculaires, sur divers modèles : truite, loup, turbot, thon, roussette, quelques invertébrés… De nombreux outils moléculaires chez le turbot ont été mis au point à Rennes avec Daniel Boujard (articles dans Endocrinology, Molecular and Cellular Endocrinology, Annals of the New York Academy of Sciences…). Un papier très apprécié sur les interactions mélatonine/hormone de croissance/prolactine est paru dans Endocrinology en 2003 et un autre dans Trends in Endocrinology and Metabolism, en 2007. Entre 1995 et 2004, Gilles Boeuf a développé une importante activité de recherche avec Patrick Payan à Nice sur la physiologie du complexe otolithe/otosac (14 publications). Un article publié en 2001 dans Comparative Biochemistry and Physiology—Part C: Toxicology and Pharmacology a figuré parmi les 5 papiers les plus cités pour l'année 2005.

2007-2014

Observatoire Océanologique de Banyuls et Muséum national d'Histoire naturelle, Paris

Après avoir rejoint le Muséum national d'Histoire naturelle, Gilles Boeuf a néanmoins poursuivi ses travaux à Banyuls avec Jack Falcón sur le rôle de la mélatonine et de ses récepteurs (avec entre autres, trois papiers dans General and Comparative Endocrinology, un papier dans PLoS one, dans le Journal of Experimental Biology, dans Molecular Ecology et un papier accepté par PNAS en novembre 2013). Au Muséum, cependant, il est amené à travailler sur des thématiques différentes, liées aux charges de président du conseil scientifique puis de président de l'établissement. À ce titre, il est en charge de l'animation de la recherche et préside le conseil d'administration du Muséum, tout en veillant à une cohérence étroite entre les cinq missions du Muséum : recherche, enseignement, collections, diffusion et expertise.

Au Muséum, il assume également une importante charge de représentation de l'établissement et de conférences, qui occupe une grande partie de son temps. Il donne ainsi plus de 80 conférences par an, sur la biodiversité, le rôle de l'eau dans les systèmes biologiques, la vie dans les océans et ses ressources vivantes, dans le monde entier et à destination de tous les publics, des laboratoires de recherche et d'enseignement au grand public.

Ses recherches actuelles portent sur les interactions entre la physiologie environnementale, l'endocrinologie et la biodiversité, sur des questions telles que « Pourquoi si peu d'espèces dans les océans, comparativement aux continents ? », « Comment la vie sort‐elle des océans ? », « Quel futur pour la biodiversité ? », « Quelles sont les limites de l'adaptabilité de l'humain ? », « Quelles sont les utilisations de la bio‐inspiration pour la transition écologique ? »… En 2010, il a publié un ouvrage consacré à la biodiversité en Méditerranée chez Oxford University Press. Ces travaux sont menés en étroite collaboration avec des équipes partenaires, apparaissant dans les publications communes. Le rapprochement avec Jean‐François Toussaint (IRMES à l'Hôtel‐Dieu) a notamment donné lieu à l'organisation, en octobre 2010, d'un colloque intitulé : « L'Homme peut‐il s'adapter à lui‐même ? » qui a fait l'objet d'une publication chez Quae en novembre 2012, et à un dossier dans la revue Futuribles, « Les piliers d'un nouvel humanisme : plafonds ou transition, quel à‐venir à la crise ? », en novembre 2013.