Résumé
Lorsqu’une maladie infectieuse émerge, il est important de rapidement estimer ses caractéristiques telles que sa transmissibilité et sa sévérité afin d’apprécier les risques qu’elle pose pour la Santé Publique. Cette estimation est cependant difficile car les épidémies ne sont qu’imparfaitement observées. Par exemple, les systèmes de surveillance n’identifient qu’une petite proportion des infections, en général les plus sévères ; les chaînes de transmission sont rarement connues, etc. Dans ce cours, je présenterai les méthodes permettant d’estimer ces paramètres épidémiologiques clés à partir de données incomplètes. Ces approches, déployées en temps réel, sont devenues essentielles pour « faire parler » les données et guider la réponse aux épidémies de maladies émergentes.