Résumé
Les bactéries vivent le plus souvent au sein de communautés structurées. Dans les biofilms, une ou plusieurs espèces s’organisent dans l’espace et produisent une matrice qui les protège et transforme leur environnement. Les microbiotes rassemblent quant à eux les micro-organismes associés à un milieu ou à un hôte, qu’il s’agisse d’un sol, d’un océan, d’une plante ou d’un animal. Ces communautés se construisent par des mécanismes de coopération, de compétition et de communication qui assurent leur organisation spatiale et fonctionnelle. Régulations génétiques, échanges de matériel génétique et complémentarités métaboliques favorisent leur adaptation collective aux perturbations, aux antibiotiques ou aux défenses immunitaires. Les microbiotes participent ainsi pleinement au développement, au fonctionnement et à la santé de leurs hôtes.
