Résumé
La recherche en microbiologie doit désormais relier l’écologie descriptive et corrélative issue de la métagénomique à une biologie fonctionnelle capable d’en élucider les mécanismes. La tâche est herculéenne, tant le fossé demeure grand entre les modèles du laboratoire et la complexité des environnements naturels. Il faut apprendre à passer de conditions homogènes à des milieux hétérogènes, des interactions entre deux partenaires aux écosystèmes. La palette méthodologique est immense : biologie structurale, génétique, imagerie, microfluidique, biologie computationnelle et intelligence artificielle. Mais cette complexité ne peut rester le jardin des seuls chercheurs. Elle doit être partagée avec les citoyens et les décideurs, notamment par l’éducation et les sciences participatives. L’enjeu est scientifique autant que démocratique : rendre visible cette matière noire du vivant, comprendre comment elle fait fonctionner la planète et décider collectivement de la manière dont nous voulons agir sur elle.
