Résumé
La métagénomique a ouvert un observatoire entièrement nouveau sur le vivant. Elle révèle que les micro-organismes colonisent tous les milieux de la planète et que la diversité étudiée au laboratoire n’en représente qu’une fraction infime. Le nombre d’espèces bactériennes demeure inconnu, avec des estimations séparées par six ordres de grandeur. Ces découvertes ont profondément redessiné l’arbre du vivant, désormais dominé par des lignées microbiennes non cultivées, comme les ultramicrobactéries du Candidate Phyla Radiation. Les Archées d’Asgard ont également renouvelé notre compréhension de l’origine des eucaryotes. Animaux, plantes et humains apparaissent ainsi sur une petite branche, relativement récente, d’un arbre immensément plus ancien et profondément microbien.